В 2009 г. уровень загрязнения воздуха оценивался как высокий в трех городах: Барнауле (среднегодовая концентрация диоксида азота составила 1,5 ПДК, бенз(а)пирена – 2,9 ПДК, формальдегида – 3,0 ПДК), Бийске (формальдегид – 4,7 ПДК, бенз(а)пирен – 1,7 ПДК), Заринске (диоксид азота – 1,8 ПДК, фенол – 1,7 ПДК, формальдегид – 4,3 ПДК).

Вода р. Чарыш оценивалась в 2009 г. как «очень грязная», рек Барнаулка, Каменка, Кулунда – «грязная», рек Бия и Катунь – «загрязненная», рек Обь, Алей, Чумыш, Тогул, Песчаная, Чемровка – «очень загрязненная».

Удельный вес проб воды подземных источников питьевого водоснабжения (артезианские скважины), не соответствующих гигиеническим нормативам по микробиологическим и по санитарно-химическим показателям, стабилизировался на уровне 2008 г. (1,6 и 23,8%, соответственно).

Количество мест организованного захоронения отходов – 1109 (отвечают действующим нормативам – 4) общей площадью 246 га.

В 2009 г. новых ООПТ на территории Алтайского края не создано.

В 2009 г. реализовывались мероприятия краевой целевой программы «Охрана окружающей среды на территории Алтайского края» на 2007–2009 годы. В 2009 г. постановлением Администрации Алтайского края утверждена ведомственная целевая программа «Охрана окружающей среды на территории Алтайского края» на 2010–2012 годы.